Genetic relationships of Caribbean lowland spiny pocket mice (Heteromys desmarestianus: Rodentia; Heteromyidae): evidence of a distinct mitochondrial lineage

Abstract

Genetic studies provide important insights into the evolutionary history and taxonomy of species, allowing us to identify lineages dif-ficult to distinguish morphologically. The relationships among species in the genus Heteromys have been in flux as new species have been described, and candidate species have been suggested in the H. desmarestianus group. One new potential species may be in Costa Rica’s Carib-bean lowlands. Herein, we test the phylogenetic relationships of individuals from Costa Rica’s Caribbean lowlands to individuals from through-out the species’ range using mitochondrial sequences from cytochrome-b (cytb). We captured 116 individuals from the lowlands, sequenced their cytb gene, and incorporated 74 GenBank sequences from throughout the species’ range to test if individuals from Costa Rica’s Caribbean lowlands potentially constitute an undescribed species. Our results document a distinct mitochondrial lineage in the Caribbean lowlands of Costa Rica. Our results from extensive sampling within the lowlands show a unique mitochondrial DNA lineage, which suggests the presence of an undescribed species. The Caribbean lowlands of Costa Rica may hold other cryptic diversity, and further phylogenetic studies should incorporate samples from this area, as it may have a unique evolutionary history.

Los estudios genéticos proporcionan información importante sobre la historia evolutiva y la taxonomía de las especies, lo que nos permite identificar linajes difíciles de distinguir morfológicamente. Las relaciones filogenéticas entre las especies del género Heteromys han estado cambiando a medida que se han descrito nuevas especies y se han sugerido especies candidatas en el grupo H. desmarestianus. Una nueva especie potencial podría encontrarse en las tierras bajas del Caribe de Costa Rica. En este trabajo analizamos las relaciones filogenéticas entre individuos de las tierras bajas del Caribe de Costa Rica con individuos de todo el rango de la especie utilizando secuencias mitocondriales del citocromo-b (cytb). Capturamos 116 individuos de las tierras bajas, secuenciamos su gen cytb e incorporamos 74 secuencias GenBank de todo el área de distribución de la especie para probar si los individuos de las tierras bajas del Caribe de Costa Rica constituyen potencialmente una especie no descrita. Nuestros resultados indican la presencia de un linaje distinto basado en el ADN mitocondrial, que sugiere que los indivi-duos de las tierras bajas del Caribe de Costa Rica probablemente son una especie distinta. Las tierras bajas del Caribe de Costa Rica pueden tener una diversidad críptica significativa. Por ello sugerimos que estudios filogenéticos adicionales deberían incorporar muestras de esta área, ya que puede tener una historia evolutiva única.